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尊龙凯时-人生就是博的蛋白质组学数据上传指南

发布时间:2025-02-23   信息来源:尊龙凯时官方编辑

在生物医学研究领域,发表论文时,期刊常常要求作者将原始数据上传至特定的第三方数据库。那么,应该将原始数据上传到哪个数据库呢?如何完成上传流程呢?本期,我们将详细整理一些国内外主流的生物医疗数据上传平台,并以常用的国内平台为例,提供详细的上传方法。

尊龙凯时-人生就是博的蛋白质组学数据上传指南

近年来,越来越多的生物医学期刊要求在发表时同步公开原始数据,这不仅可以供审稿人验证数据与处理流程,以确保实验的可重复性与真实性;同时,每次投稿时也无需单独上传庞大数据,只需在文章中标注公共平台的数据项目ID,从而节省本地资源,使投稿过程变得简单快捷。此外,数据公开还促进了学术界在数据存储与共享方面的合作,节约科研经费,并能够提升研究的影响力与引用率。最后,数据公开符合伦理规范,推动研究者提供真实可靠的数据,防止学术不端现象。因此,选择一个公认且可靠的数据公共平台显得尤为重要。

在众多数据平台中,ProteomeXchange(由欧洲分子生物实验室主导的蛋白质组学数据共享联盟)是目前最常用的蛋白质组学数据储存平台,旨在为全球研究者提供标准化和高质量的蛋白质组数据存储与共享服务。作为收录蛋白质组数据集最多的平台,ProteomeXchange通过其全球节点网络,实现了数据的无缝整合与跨平台访问,为研究者提供了高效、可靠的数据共享平台,并会继续推动全球科研数据的开放共享与合作。

ProteomeXchange联盟由六大核心成员组成,各平台在功能定位上各有侧重,包括PRIDE Archive、MassIVE、PeptideAtlas、jPOST、Panorama Public,以及中国的iProX。其中,iProX是国内学者上传数据的最佳选择,尤其适合与人类遗传学等敏感数据相关的研究者。

接下来,我们将探讨如何通过iProX进行蛋白组学原始数据的上传流程。

1. 数据准备

请确保文件命名格式为研究缩写_数据类型_日期(例如:HCC_RAW_20231001),以避免使用特殊符号。

2. 账号注册与登录

如果尚未注册iProX账号,请进入iProX官网,点击右上角“Register”,填写必填信息(姓名、单位、职称、密码、邮箱、地区等),完成账号注册后,确认邮箱以激活账号,接着点击“Signin”登录。如果已注册,则根据提示输入账号、密码及验证码进行登录。

3. 项目创建

iProX提交系统以项目为单位进行数据管理,在登录后可通过多种方式创建新项目。在操作过程中,如果页面提示安装或升级IBM Aspera插件,请根据说明进行安装。

4. 项目信息填写

填写项目信息时,确保必填项已完整填写。完成后,点击“Continue”以保存信息。如遇到填写错误,按照提示逐步修改。

5. 填写子项目信息

子项目信息填写涉及具体实验细节,如物种、组织类型及质谱仪型号等。选择物种时,可通过搜索功能找到所需信息。

6. 数据上传

目前,iProX支持完整提交和部分提交两种上传方式。推荐使用部分提交中的“upload by Aspera”方法。通过点击“Add file”添加数据文件后,点击“Start upload”即可启动上传过程。

7. 数据分享与iProX ID查询

若需要分享iProX中的数据,可选择相应的项目后,点击“Share”,生成一个含密码的链接。文章中需提供质谱原始数据时,只需列出iProX ID即可。

通过这些步骤,您可以在生物医疗领域轻松上传和共享研究数据,确保数据的可靠性与广泛性。为了让自己的研究更具影响力,选择尊龙凯时-人生就是博,助力您的科研之路!